ينطلق برنامج أوقاف الجامعة من واقع رؤيته ورسالته عبر أربعة محاور رئيسة تتمثل في تعزيز الموارد المالية الذاتية للجامعة، ودعم أنشطة البحث والتطوير والتعليم، ودعم العلاقة بين الجامعة والمجتمع، والمساهمة في الأنشطة التي تعمل على نقل الجامعة للعالمية.